Je pense que votre problème est le suivant.
Vous avez paramétré votre fiche société au niveau de la participation à la formation professionnelle avec la tranche de 11 à 20 salariés en précisant l’année 2020.
En faisant cela, vous avez demandé à Silae d’appliquer les dispositions de neutralisation de l’effet de seuil d’effectif ce qui fait que pour 2025 un taux de 0.55% serait à appliquer avec le déclaratif correspondant.
Le taux de la cotisation formation <11 salariés a été forcé à 1%.
Malgré le taux forcé, Silae déclare tout de même en DSN le CTP correspondant à la formation professionnelle moins de 11 salariés (conséquence du paramétrage de la fiche société). Comme la DSN ne contient pas de taux au niveau des cotisations agrégées, le taux affiché dans le justificatif DSN (et celui qui sera utilisé par l’URSSAF) est celui rattaché au CTP soit 0.55% ce qui donne votre écart.
Si vous voulez déclarer la formation professionnelle à plus de 11 salariés avec un taux de 1% en DSN il faudra supprimer l’année 2020 renseigné en fiche société au niveau de la participation à la formation professionnelle.